降低面團濕筋度、改良面團可塑性及理化性質，同時使蛋白質大分子水解成短肽和氨基酸，從而有利于糖類和氨基類物質進行復雜的美拉德反應，使產品上色快，色澤悅目有油潤光鮮感，疏松酥脆容比力大，斷面網狀結構明顯，層次好；

含木瓜蛋白酶的***，如木瓜潤喉片、木瓜腸溶片（膠囊）、木瓜含片，具有***、利膽、止痛、助消化、***等功效，進一步研究表明亦可用于檢查紅細胞表面及血型鑒別劑、***婦科病、青光眼、昆蟲的叮咬等。

用于香皂、肥皂、洗滌劑、洗衣粉、洗手液等，衣物被血漬,牛奶,果汁,醬油油脂等污染后,如用普通洗滌劑,則一般很難消除這些污漬。如若在洗滌劑中加入蛋白酶可使汗?jié)n,血漬容易除去，去污力強，***消毒、安全放心。

木瓜酶作用于人體皮膚老化角質層，促使其分解退化、去除達到***效果及促進細胞生長的效果，且木瓜酶水解物在皮膚表層形成一層氨基酸衍物薄膜，使肌膚保持潤濕與光滑；木瓜酶易于與形成***的黑色素中的銅離子形成絡合物，減少黑色素的形成和去除***的黑色素，且木瓜酶水解的三肽物質可直接抑制形成黑色素的酪氨酸活性、消除自由基作用，從而達到美白去斑的效果

此外還可加入加牙膏、漱口水、牙粉等,可清潔口腔，除去牙垢和牙結石，與其它溶劑配合可制成隱形眼鏡的清潔消毒劑以及感光膠片銀的回收等。

反應溫度50—55℃，溫度因底物的種類及濃度不同而有所改變；適宜PH值6—7，PH可因底物的種類、濃度不同而有所改變；添加量一般為0.1—0.3%(1000—3000u/g蛋白質)，根據不同底物作適當增減，反應時間作相應縮短或延長。