若考慮碳捕集成本（如CCUS技術），則甲醇制氫的總成本將進一步增加。CCUS碳捕集成本為375元/噸二氧化碳，而制備1千克氫氣對應約11.675千克二氧化碳排放，因此增加的成本約為4.38元/千克。在考慮碳捕集成本后，甲醇制氫的成本變化區(qū)間可能為21.37至37.61元/千克（具體取決于甲醇價格和其他成本因素）。
藍氫”是在灰氫的基礎上，將CO2副產品捕獲、利用和封存（CCUS），以減少生產過程中的碳排放，實現低碳制氫。綠氫”是通過可再生能源（如風電、水電、太陽能）制氫、生物質制氫等方法制得的氫氣，生產過程基本不會產生二氧化碳等溫室氣體，了綠氫的生產過程零排放。
這個過程需要消耗大量的電能，因此提高能源轉換效率是電解水制氫技術的主要攻關方向之一。此外，還有通過甲醇重整或甲醇蒸汽重整等工藝將液態(tài)甲醇轉化為高純度氫氣的甲醇制氫技術，其工作原理是利用化學反應將甲醇轉化為氫氣。
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